Morsøs ovne er EN-godkendte til fyring med træ og træbriketter. Er ovnen først og fremmest anskaffet som hyggespreder, er træ et naturligt valg. Efterfølgende beskrives kort de mest anvendte brændselstyper:

                                          
                                          Se en sammenligning af energipriser

Træ er en økonomisk opvarmningsform og samtidig en miljøvenlig energiressource. Når man fyrer med træ i brændeovnen, udvikles der ikke mere CO2 i forhold til den mængde der afgives end, når træet ligger og rådner i naturen. Selv om du skal købe træet i skoven, er der økonomisk gevinst ved brændefyring i forhold til fyring med olie, el eller gas. Træfyring kræver kortere fyringsintervaller end andre brændselsarter. Til gengæld opleves en hurtigere og behagelig opvarmning.
Det er forbudt at fyre med spånplade, malet og trykimprægneret træ, da dette udsender giftig røg.

Briketter er velegnet som supplerende brændsel, hvis man eksempelvis ønsker at fyre over længere perioder.  Både brunkul- og træbriketter er let antændelige oven på et glødelag af træ.

Koks og energikoks er gasfattige brændselstyper, og kun få ovne er konstrueret til koksfyring, da det er nødvendigt med en stor lagtykkelse for at få en god brændselsøkonomi. Morsøs 3310 er specielt velegnet til fyring med koks.

Hvilke typer brænde er bedst?
De tunge, hårde træsorter som f.eks. eg, bøg og ask har størst brændværdi. Gran, der er en let træsort har mindst brændværdi. Der beregnes ca. 7 skovrummeter bøge – eller egetræ pr. 1000 liter fyringsolie. Fyrer man med  rød- eller ædelgran, skal man bruge mellem 10-11 skovrummeter pr. 1000 liter fyringsolie.

Er brændet tørt?
Man kan selv kontrollere, om brændet er tørt nok. Det mest præcise er at bruge en fugtmåler, som findes i Morsø tilbehørsprogram.

Selv om der kan fyres med næsten alle former for træ i Deres Morsø ovn, skal man ikke fyre med vådt eller ulagret træ. Træ bør under tag lagres mindst 1 år og helst 2 år med fri adgang for vind. Træ skal kløves hurtigst muligt efter fældningen, hvis det skal tørre hurtigt. Træet kan anvendes, når fugtigheden er under 20%. Under EN afprøvningen testes alle brændeovne med træ med et fugtindhold på (16 ± 4)%. 

Fugtigt træ kan være årsag til røg og luftgener. Man må gerne bruge affaldstræ fra træindustrien, hvis det ikke er imprægneret eller bleget med f.eks. saltvand eller syre. Der er dog ikke så stor brændværdi i affaldstræ, idet træet er ovntørret og dermed har for lavt vandindhold. Ovntørret brænder meget hurtigt og kræver rigeligt med luft. Drivtømmer og lignende egner sig ikke som brændsel, fordi det kan beskadige brændeovn og skorsten i form af rust eller tæring.